La 1re partie s'attarde sur la relation entre Élisabeth et son ami et confident Robert Dudley, 1er Comte de Leicester, et comment leur romance a traversé la proposition de mariage avec le jeune duc d'Anjou, la guerre avec l'Espagne, et l'exil du comte de la cour, pour finir avec la mort de celui-ci en 1588. La 2e partie suit Elisabeth dans les dernières années de son règne, au cours desquelles elle a une liaison avec le beau-fils du Comte de Leicester, le Comte d'Essex, dont les ambitions politiques sont souvent mises en défaut par sa dévotion et sa loyauté envers la reine. Celle-ci, trouvant que le comportement de son favori devient de plus en plus répréhensible, se rapproche de Robert Cecil, qu'elle nomme Secrétaire d'État à la mort de Sir Francis Walsingham. Tout au long des épisodes, Elisabeth, qui n'a pas d'héritier mâle, doit faire face aux problèmes de succession. Sa cousine Marie d’Écosse, emprisonnée, et son fils Jacques, trament pour obtenir le trône à sa mort, mais elle reste déterminée à ce qu'aucun des deux ne prenne sa place à sa mort.

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